北京新冠疫情高峰未见新变异株?

2024-09-01 生活百科 By:如何转开发
导读《柳叶刀》发表高福团队研究论文。 该论文称,在中国逐步调整防疫措施后,新冠肺炎的感染病例急剧增加,引发了人们对可能出现新变异菌株的担忧。从2022年11月14日至12月20日收集的413例新冠肺炎感染新病例的基

《柳叶刀》发表高福团队研究论文。

该论文称,在中国逐步调整防疫措施后,新冠肺炎的感染病例急剧增加,引发了人们对可能出现新变异菌株的担忧。从2022年11月14日至12月20日收集的413例新冠肺炎感染新病例的基因组分析显示,所有病例均由现有菌株引起,其中超过90%涉及Omicron突变株BA.5.2或BF。7,未发现新菌株。

北京时间2月9日,该研究在《柳叶刀》在线发表。作者认为,由于北京人口的特点和北京高传染性新冠肺炎株的传播,上述结果是中国疫情的缩影。

该研究由中国国家重点R&D计划和中国科学院战略优先研究计划资助,由中国科学院北京疾病预防控制中心、中国疾病预防控制中心和中国科学院大学的研究人员开展。北京市疾病预防控制中心副主任王权义、中国科学院院士、中国科学院微生物研究所研究员高福为通讯作者。

2022年11月14日至12月20日,北京发现地方亚变异株。来源:柳叶刀。

文章称,自2019年12月起,本研究作者定期采集北京地区输入性病例和新冠肺炎本地病例的呼吸道样本,随机抽取样本进行分析。在2022年12月之前,北京没有该病毒持续传播的报告。在这项最新研究中,作者分析了2022年在北京检测到的新冠肺炎样本。利用快速大规模测序技术生成基因组序列,利用已有的高质量新冠肺炎序列分析其进化和种群动态。

该研究共包括2881个高质量序列。2022年11月14日至12月20日,随机抽取413份新样本进行测序。其中350例为本地病例,63例为输入性病例。

对413个新序列的分析表明,它们都属于已知的新冠肺炎毒株。2022年11月14日后,北京地区优势菌株为BF.7,占本地感染病例的75.7%。Omicron突变株的另一个分支BA.5.2占本地感染病例的16.3%。同期输入性病例涉及的菌株有BQ.1和XBB.1,分别占20株和6株。它们是世界上占优势的变异体,但在北京本地感染病例中未检出。

左图为2022年北京地区流行的新冠肺炎突变株构成,右图为2022年11月14日后北京地区传播的新冠肺炎突变株构成。内圈代表分支的构成,外圈代表每个分支中的详细谱系。来源:柳叶刀。

2022年11月14日后,北京地区BA.5.2和BF.7的有效群体增加,表明这两个家系的遗传多样性增加。ba . 5.2 2022年11月14日至25日有效人口规模变化不大,2022年11月30日前后急剧增加。与此同时,2022年11月30日前后BA.5.2感染病例也有所增加。从2022年11月14日开始,BF.7的人口规模逐渐增加。

北京BA.5.2和BF.7有效群体增长时间轴。来源:柳叶刀。

作者承认这项研究存在一些局限性。虽然只分析了北京2022年的数据,但是作者说这些数据可以代表全国的情况。由于强制大规模检测结束,无法获得2022年12月实验室确认的新冠肺炎病例数,说明真实感染病例数被低估,导致数据存在一定程度的抽样偏倚。需要更多的样本来研究Omicron突变体亚组分的传播和致病性。虽然病毒的进化速度可能因毒株不同而不同,但作者认为,在疫情爆发初期,病毒的进化速度是恒定的。

高福告诉《柳叶刀》:“鉴于变异毒株对疫情过程的影响,有必要调查近期我国新冠肺炎防控政策调整后是否出现新的变异毒株。我们的分析表明,奥米克隆突变株的两个已知亚片段是目前北京病例激增的主要原因,它们可能同样适用于整个中国。然而,随着新冠肺炎在中国的大规模传播,我们有必要继续密切监测疫情,以便尽快发现任何可能出现的新变异体。”

“世界迫切需要来自中国各地和其他地方的及时的基因组和其他数据,如病例和死亡人数的可靠数字。重要数据的快速顺畅流动是应对持续的新冠肺炎疫情和许多其他健康威胁的关键。”南非斯泰伦博斯大学的沃尔夫冈普雷塞教授和艾佟马蓬加博士在《柳叶刀》分发的评论文章中写道:“我们很高兴看到这些迫切需要的来自中国的数据。幸运的是,研究没有发现关于新突变体的证据,但结果并不出人意料:有效控制措施的突然停止可以充分解释病例数量的激增。”

不过,他们表示,在根据北京的数据对全国形势下结论时,仍需谨慎。“对于一个幅员辽阔、人口密集的国家,我们不能根据新冠肺炎单个地区的分子流行病学特征来推断全国的情况。在中国的其他地区,可能会出现其他的进化趋势,这可能包括可以被人类感染,进一步进化后‘溢出’的动物病毒。”

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